航空发动机的控制系统是航空发动机重要组成部分，它依据发动机的状态和发动机外界环境的变化控制发动机的各调节参数，保证发动机工作稳定和提高发动机性能。其主要实现的控制有：输出参数（推力或功率）控制；燃油流量控制；压气机可调静子叶片控制；可调放气活门控制；涡轮间隙主动控制；高压压气机、涡轮冷却空气流量控制；发动机滑油和燃油温度管理；发动机安全保护；启动和点火控制；反推控制等。
从控制系统实现的方式上区分，航空发动机的控制系统可分为：机械液压式控制（或机械气动式控制）；监控型电子控制；全权限电子控制(Full Authority Digital Engine Control)。
航空发动机使用中的数据监控，通过安装在发动机上面的特定传感器来收集发动机各大主要部件的运转情况以及整体工作情况。然后无线上传到卫星或者临近的地面站。一旦得到的数据表明发动机出现异常，航发生产制造商的技术支援部就会得到报警并立刻通知飞行中的航班机组，指示其采取应对措施例如就近迫降。典型的例子是马航370客机失踪后，确切的线索是其航发自动上传的运行数据。